Fox Mulder und Dana Scully, die beiden Hauptfiguren, sind FBI-Ermittler.
Fox Mulder wurde 1961 geboren. Er ist Psychologe und Profiler, spezialisiert auf Fälle mit paranormalen Phänomenen. Er hat eine vier Jahre jüngere Schwester Samantha, die im Alter von acht Jahren in seinem Beisein von Außerirdischen entführt wurde. Seine Eltern sind geschieden. Nach einem Aufenthalt in den Abteilungen für Verhaltenswissenschaften und Gewaltverbrechen des FBI entdeckte er die X-Akten, Akten über ungelöste Fälle mit unerklärlichen Phänomenen. Er ist Atheist, glaubt aber an paranormale Phänomene und an die Existenz Außerirdischer und hat eine Neigung zu Verschwörungstheorien.
Dana Scully wurde 1964 geboren. Sie ist Ärztin und Wissenschaftlerin; sie schrieb im Rahmen eines Physikstudiums eine akademische Arbeit über Einsteins Zwillingsparadoxon. Sie hat zwei Brüder (Charlie, der jüngere und Bill, der ältere Bruder) und eine Schwester, Melissa. Scully ist Skeptikerin gegenüber dem Paranormalen, gleichzeitig aber gläubige Katholikin. Nach ihrer Tätigkeit als Lehrbeauftragte für forensische Medizin an der FBI-Akademie wurde sie den X-Akten zugeteilt, um Mulders Arbeit wissenschaftlich zu "überprüfen" (oder: als Humbug zu entlarven).